Inactivación del virus Zika con medio de transporte de ácidos nucleicos, potencialmente aplicable a muestras clínicas para el diagnóstico molecular de SARS-CoV-2 / Inactivation of Zika virus with nucleic acids transport media, potentially applicable to clinical samples for the molecular diagnosis of SARS-CoV-2

RESUMEN Introducción: Los medios de colecta de muestras clínicas con capacidad de desnaturalizar virus reducen los riesgos de contagio durante el transporte y procesamiento. Objetivo: Emplear el medio de transporte de ácidos nucleicos (TAN) en muestras de exudado nasofaríngeo colectadas para el diagnóstico de SARS-CoV-2. Métodos: Se realizó un estudio experimental para demostrar la capacidad del medio de inactivar la infectividad viral. Se tomó como modelo de virus envuelto el virus Zika (VZk), cuyo nivel de bioseguridad es 2. Se evaluó el desempeño clínico del medio TAN para el diagnóstico de SARS-CoV-2. Se empleó una cepa del VZk propagada en la línea celular Vero y, previo a la infección de las células, el VZk se puso en contacto a intervalos de tiempo diferentes (2; 15 y 30 min) con el medio TAN puro; y luego se realizaron diluciones seriadas (10-1-10-4). La inactivación viral se evaluó por RT-PCR, en el sobrenadante y células colectadas, al culminar el periodo de propagación. El desempeño clínico del medio TAN se estimó tomando como referencia el CITOSWAB® VTM, en 30 exudados nasofaríngeos colectados para diagnóstico de la infección por SARS-CoV-2. Resultados: El VZk preservó su infectividad a diluciones del inóculo ≥ 10-2, independientemente del tiempo de contacto. La sensibilidad y especificidad clínica del medio TAN para el diagnóstico de SARS-CoV-2 fueron del 100 %, respectivamente. Conclusiones: Los resultados sugieren que muestras clínicas positivas a VZk en diluciones ≤ 10-1 del medio TAN pueden ser manipuladas de forma segura, lo que pudiera aplicarse potencialmente al diagnóstico molecular del SARS-CoV-2.

ABSTRACT Introduction: Collection media of clinical samples with the capacity to denature viruses reduce the risk of contagion during transportation and processing. Objective: To use the nucleic acids transport media (NATM) in nasopharyngeal swab samples collected for the diagnosis of SARS-CoV-2. Methods: An experimental study was conducted to demonstrate the medium capacity to inactivate viral infectivity. Zika virus (ZIKV), of biosafety level 2, was used as an enveloped virus model. The clinical performance of the NATM for the diagnosis of SARS-CoV-2 was evaluated. A ZIKV strain propagated in the Vero cell line was used and, prior to cells infection, ZIKV was in contact at different intervals (2; 15, and 30 min) with pure NATM; subsequently, serial dilutions (10-1-10-4) were performed. Viral inactivation was evaluated by RT-PCR in the supernatant and the collected cells when the propagation period was completed. CITOSWAB® VTM was used as reference to estimate the clinical performance of the NATM in 30 nasopharyngeal swabs collected for the diagnosis of SARS-CoV-2 infection. Results: ZIKV remained infectious at inoculum dilutions of ≥ 10-2, regardless of contact time. Clinical specificity and sensitivity of the NATM for the diagnosis of SARS-CoV-2 were 100%, respectively. Conclusions: Results suggest that ZIKV positive clinical samples at dilutions ≤ 10-1 of the NATM can be safely handled, which could potentially be applied to the molecular diagnosis of SARS-CoV-2.

Asociación entre blastocistosis y anemia por déficit de hierro en mujeres embarazadas en el municipio La Lisa, La Habana, Cuba / Association between Blastocystosis and Iron Deficiency Anemia in Pregnant Women in La Lisa Municipality, Havana, Cuba

Introducción: Estudios recientes encontraron asociación entre blastocistosis y anemia por déficit de hierro. Uno de ellos demostró que en mujeres embarazadas la infección por Blastocystis spp. es un factor de riesgo para padecerla y puede tener consecuencias adversas tanto para la madre, como para el feto que en casos extremos puede conducir a mortalidad maternofetal. Objetivo: Conocer la prevalencia de blastocistosis en mujeres embarazadas y su posible asociación con la anemia ferropénica. Métodos: Se realizó un estudio parasitológico, clínico y epidemiológico, de tipo descriptivo y de corte transversal, al universo de las gestantes atendidas en tres policlínicos del municipio La Lisa, entre julio 2017 y junio 2018. Resultados: De 135 embarazadas, 43 (31,9 por ciento) estaban infectadas por protozoos parásitos. De estos, Blastocystis spp, fue el más prevalente (28,9 por ciento). Del total de gestantes, 41 padecían de anemia. En la mayoría de estas (85,4 por ciento), la anemia clasificaba como ferropénica. La proporción de embarazadas parasitadas por Blastocystis spp. que padecían este tipo de anemia, en relación con las gestantes que no estaban infectadas por ese protozoo y también padecían de ese tipo de anemia fue significativamente mayor (p lt; 0,05). Conclusiones: Blastocistosis es una parasitosis de prevalencia creciente e insuficientemente conocida. Iniciativas para mejorar conocimientos, percepciones y prácticas en relación con su diagnóstico, tratamiento y control son perentorias a nivel popular y académico. Las estrategias de comunicación que se implementen deben informar sobre las posibles consecuencias clínicas de la infección en relación con la mujer embarazada(AU)

Introduction: Recent studies found an association between blastocystosis and iron deficiency anemia. One of them showed that the infection with Blastocystis spp is a risk factor for in pregnant women to suffer. This infection can have adverse consequences for both the mother and the fetus. In extreme cases it can lead to maternal and fetal mortality. Objective: To know the prevalence of blastocystosis in pregnant women and its possible association with iron deficiency anemia. Methods: A parasitological, clinical and epidemiological study, descriptive and cross-sectional was conducted on the universe of pregnant women treated in three clinics in La Lisa municipality from July 2017 to June 2018. Results: We found 43 (31.9 percent) pregnant women infected by parasitic protozoa out of 135 who were studied. Blastocystis spp, was the most prevalent (28.9 percent). 41 pregnant women suffered from anemia. In most of them (85.4 percent), anemia classified as iron deficiency. The proportion of pregnant women parasitized by Blastocystis spp who suffered from this type of anemia was significantly higher (p lt;0.05) in relation to pregnant women who were not infected by that protozoan and also suffered from that type of anemia. Conclusions: Blastocystosis is a parasitosis of increasing prevalence which is insufficiently known. Initiatives to improve knowledge, perceptions and practices are peremptory to their diagnosis, treatment and control at the general and academic levels. The communication strategies that are implemented should inform about possible clinical consequences of this infection in pregnant woman(AU)

Evaluación de los test rápidos en el Hospital General de Bata, Guinea Ecuatorial / Assessment of rapid tests at Bata General Hospital, Equatorial Guinea

En los últimos años, los test rápidos han ganado importancia en el diagnóstico de la infección por VIH y otras infecciones de transmisión sexual. Aunque la sensibilidad de los nuevos test es comparable a la de las técnicas de Ensayo Inmunoenzimatico, la especificidad es algo menor. El propósito del trabajo ha sido examinar el rendimiento de las pruebas diagnósticas "rápidas" utilizadas en el Hospital Regional de Bata, Guinea Ecuatorial, para VIH, hepatitis B, hepatitis C y sífilis y verificar si realmente son las mejores para los diagnósticos de salud o enfermedad de los individuos. Se realizó un estudio con diseño observacional analítico, transversal de pruebas diagnósticas. Se determinó sensibilidad, especificidad, valor predictivo positivo, valor predictivo negativo, y razones de verosimilitud positiva y negativa. Se encontró que de los 356 especímenes estudiados, 193 (54,2%) tuvieron resultado positivo de todas las pruebas en conjunto. La probabilidad de que una prueba diagnostique correctamente a un individuo enfermo fue de 70,6%, con variaciones entre los diferentes diagnósticos., en general se diagnostican mejor los enfermos y no siempre los sanos se pueden descartar como verdaderos negativos. La confirmación del diagnóstico debe ser realizada en conjunto con otras técnicas, poco disponibles en este país.

In recent years rapid tests have been gaining importance in the diagnosis of HIV infection and other sexually transmitted infections. Although sensitivity of the newer tests is comparable to Immuno-enzymatic assay, the specificity is lower. The purpose of this study is to examine the performance of the rapid tests used in Bata Regional Hospital, Equatorial Guinea for HIV, B and C Hepatitis, and Syphilis assessing if they are really useful and the best for detecting diseases or health conditions of the individuals. An observational, analytic, and cross sectional study was performed including the diagnostic tests and sensitivity, specificity, positive and negative predictive values, so as the positive and negative probability ratios, with 95 % confidence intervals and calculated for every test respectively. Agreement was proved using Cohen Kappa test at 95 % of confidence level. From de 356 specimens, 193 (54.2 %) showed positive results for the entire set of tests. The probability of that, a rapid test correctly diagnose a person suffering from a disease was 70.6 %, showing variations among the different tests. The rapid test diagnoses better the sick person, but the healthy ones not always can be ruled out. The confirmation of the diagnosis must be carried out using other techniques, rarely available in this country.